Como o console Gameboy Advance é de porte menor, o motor gráfico de Tournament Edition é bem menos desenvolvido do que o Deadly Alliance para Playstation 2 e Xbox. Os controles são praticamente os mesmos com algumas diferenças pois o Gameboy Advance só possui um botão para soco e um para chutes. É possivel trocar de estilo de luta como no Deadly Alliance original, mas os golpes com armas funcionam como movimentos especiais de pouca duração, ex: baixo-atrás-soco.

A grande diferença está na seleção de arenas (desbloqueando na The Krypt), os "Weapons Fatalities", onde o personagem depois de um sequência de teclas, o personagem mutila o inimigo com sua arma. Há menos personagens, e Sareena, Sektor, e Noob Saibot, não tem fatalities surpreendentes como os outros personagens, mas fatalities simples, acertando o inimigo com uma sequência de chutes e socos e terminando com um special move. O fato mais interessante sobre esta versão de Deadly Alliance é a opção de selecionar o personagem com as cores das roupas e armas diferentes, como por exemplo, podemos pegar Cyrax com uma cor cinza, fazendo pensar que seja Smoke, ou também Scorpion com uma cor vermelha, dando a imaginar ser Ermac (personagens não presentes neste jogo).

Plataforma : GBA
Lançamento : 2003