Killer Instinct Gold é a versão de Nintendo 64 de Killer Instinct 2. Ela foi lançada pouco tempo após o console. Entretanto, KI2 e KI Gold são o mesmo jogo, mas com algumas diferenças, como ter mais opções na versão Gold, como o "Team Battle", onde cada um pode jogar com até os 11 jogadores; "Team Elimination Battle", no qual o jogador é obrigado a acabar com os seus oponentes usando os movimentos fatais (movimentos de finalização, semelhantes aos Fatalities da série Mortal Kombat) ao invés de simplesmente derrotá-los com movimentos normais; e Training e Advanced Training, no qual o jogador pode aprender os movimentos básicos e avançados do jogador que ele escolher. KI Gold também é compatível com o "Controller Pak" do Nintendo 64 para salvar opções e placares, embora o cartucho tenha uma bateria interna.

No entanto, ao contrário da versão de arcade, esta versão de console teve a maior parte de suas cenas, encerramentos etc e até vários quadros de animação removidos devido a limitação do hardware do cartucho do Nintendo 64. Isto aconteceu por causa do sistema básico do cartucho que, por causa das cutscenes serem exibidas em tela cheia poderiam ocupar centenas de megabytes de espaço. Alguns quadros tiveram de ser removidos ou substituidos. Para compensar a perda de animação, todas as fases do jogo foram completamente renderizadas em 3D.< width="480" height="385">